Olink技术白皮书|用蛋白组学赋能基因组学,解码生命奥秘

首页    Olink技术白皮书    Olink技术白皮书|用蛋白组学赋能基因组学,解码生命奥秘
 

 

 

人类基因组计划为发现更有效的新型药物靶点带来了希望。近期的一项研究表明:在美国FDA批准的药物中,三分之二(在2021年批准的50种药物中有33个)涉及到“遗传和功能基因组学数据的多重整合”以及“关于疾病的分子及表型特征的临床知识”[1]

而在丰富的全基因组关联研究(GWAS)历史和大量的遗传信息中,研究规模化人群蛋白质组学的新方法将有助于研究人员识别导致疾病的蛋白质和通路,并支持识别潜在药物靶点的系统研究。

 
 
英国生物样本库(UK Biobank)
 
 
 
 
英国生物样本库(UK Biobank)
 
成立于2006年,作为长期、大型的生物医学资源和数据库,从50万英国参与者中深入收集遗传信息与健康信息。在2020年,英国生物样本库宣布与13家制药企业合作共同资助一项采用 Olink Explore 1536 检测数万个样本的研究,并称这项合作研究为“英国生物样本库制药蛋白组学项目联盟”(UKB-PPP)。
在研究中[2],UKB-PPP 联盟报道了超过8,000个在基因变异与循环蛋白质水平之间的全新的蛋白-基因组关系 pQTL(蛋白定量性状位点),其中包括已报道过的2,000多个位点。

1. 主要顺式(cis-)和反式(rans-)蛋白定量性状位点(pQTL)关联数与样本量大小的关系。改编自参考文献2,图片2e

 
 
SCALLOP 联盟
 
 
SCALLOP 联盟
包括了来自28 个机构的35 名研究人员,拥有45个队列研究和7, 0 0 0 名患者[3]的所有基因组和蛋白组数据和临床表型信息。他们开创性的工作解释了451个主要遗传关联,25个代表了新药物靶点的因果蛋白,并揭示了18个药物新用途靶点[4]。其中25个因果蛋白连接起了遗传相关性与真实的疾病病理学之间的缺口。
 
UK-PPPSCALLOP联盟的里程碑式研究为蛋白质组学和潜在治疗靶点发现的系统性研究方法建立了信心。
 

1. Ochoa D and Dunham I et al. Human genetics evidence supports two-thirds of the 2021 FDA-approved drugs. Nat Rev Drug Discov. 2022 21(8):551.doi:10.1038/d41573-022-00120-3

2. Sun BB and Whelan CD et al Genetic regulation of the human plasma proteome in 54,306 UK Biobank participants. bioRxiv 18 June 2022doi:10.1101/2022.06.17.496443

3. http://www.scallop-consortium.com/

4. Folkersen L and Malarstig A et al. Genomic and drug target evaluation of 90 cardiovascular proteins in 30,931 individuals. Nature Metab 2020 2(10):1135-1148. doi:10.1038/s42255-020-00287-2

 

 

点击下载《以蛋白质组学赋能基因组学》白皮书,获取更多信息。

 

2023年2月3日 10:48
浏览量:0