【Clinical Infectious Diseases】Olink蛋白组学助力mRNA新冠疫苗接种免疫力脆弱人群精准疫苗学研究
免疫力脆弱人群在进行免疫接种后会有不同于正常人的免疫学特征，从而导致疫苗接种后的免疫原性、持久性及有效性不佳，因此系统免疫学研究一直是疫苗治疗研究中的热点。例如，卡罗琳学院的研究者去年发表在Rheumatology风湿病杂志上的文章中研究跟踪了红斑狼疮SL患者在接种流感疫苗过程中，通过量化对病毒抗原、免疫细胞和Olink蛋白组参数的抗体反应，从而了解血清蛋白生物标记物是否可用于预测疫苗特异性抗体的产生的水平[1]。
新文速递
感染病学顶级权威杂志美国感染病协会(IDSA)会刊Clinical Infectious Diseases（IF=20.999），近期发表了来自意大利罗马儿童医院、美国波士顿儿童医院、麻省理工学院和哈佛医学院等全球著名研究机构发起的针对青少年和年轻人群里中的免疫缺陷人群在接种辉瑞BNT162b2 mRNA疫苗的特异性系统免疫学特征[2]。
研究组中HIV阳性患者接种了辉瑞BNT162b2 mRNA疫苗后，通过血浆蛋白质组学和体液/细胞免疫应答，探索研究因慢性疾病而具有不同免疫力的患者群体，对包括SARS-CoV-2在内的不同传染病源的疫苗反应性，为进一步研究免疫力脆弱人群中有针对性的疫苗干预提供见解基础，也是近年来精准疫苗学的关注点。
研究解读
研究对象包括两个队列：28例接受抗逆转录病毒治疗（ART）的HIV阳性新冠患者队列和65未感染新冠的健康对照队列。对两个队列的个体在接种BNT162b2 mRNA疫苗基线（D0）、第二次剂量（D21）、接种后第4周（D28）和第6个月（D180）采集收集样本，进行安全性和免疫原性评估。
使用Olink炎症和免疫反应panel的180个蛋白标志物，对研究队列中D0天和D28天受试者血浆进行蛋白质组特征研究。为排除年龄差异带来的潜在影响，因年龄因素带来的蛋白表达差异个体被剔除（N=45）。去除年龄因素的队列研究结果发现，HIV感染会导致清晰可识别的特异蛋白组特征。
通过主成分分析（PCA）通路富集进一步发现排名前20的PC2负荷分子对特异蛋白组特征贡献最多。通过与细胞反应数据结合分析发现，宿主解旋酶RLRs识别病毒病原RNA，并通过I型干扰素和炎症细胞因子触发先天抗病毒反应。更有趣的是，在D0天和D28天的蛋白组学研究中发现，HIV阳性患者有6个蛋白标志物在D28天差异性表达，而这一现象在健康组中未被发现，这也暗示BNT162b2 mRNA疫苗在D28天第二针加强剂量后，并不引发稳定的蛋白质水平的改变。
首次报道辉瑞BNT162b2疫苗在艾滋病阳性队列中的血浆蛋白组、体液和细胞免疫机制研究。在宿主血浆蛋白组学基线对比中发现，Olink panel中的蛋白标志物可讲研究对象清晰的分为两个不同的队列。系统疫苗学整合研究最近表明，基线的蛋白质组特征或可预测疫苗在不同人群（包括健康人）中的免疫原性。总之，以上研究表明接受抗逆转录病毒治疗，且CD4+T细胞数量正常的围产期艾滋病毒阳性患者，不需要缩短额外剂量的COVID-19疫苗接种计划。而结合多组学数据的精确疫苗学将整合临床、免疫学和系统生物学数据，为脆弱人群量身定制疫苗，以获得最佳的安全性和有效性。
1.Interferon activation status underlies higher antibody response to viral antigens in patients with systemic lupus erythematosus receiving no or light treatment,Rheumatology, Volume 60, Issue 3, March 2021, Pages 1445–1455,
2.Perinatally Human Immunodeficiency Virus-Infected Adolescents and Young Adults Demonstrate Distinct BNT162b2 Messenger RNA Coronavirus Disease 2019 Vaccine Immunogenicity. Clin Infect Dis. 2022 Aug 15;75
