非标样本准备要求—细胞培养上清
对血清和血浆样本,Olink 进行了充分的优化与验证,故不再需要预实验。
除此之外的其他样本类型(非标样本),蛋白质组成及含量参差不同,进行预实验可以确保在最佳条件下分析样本,保障检测指标在有效的动态及线性范围内,以及排除有可能存在的过饱和风险。因此我们强烈建议非标样本都需进行预实验:
Olink 建议的预实验内容包括:
- 至少选择6-12个样本(即每个组别分别选取3-6个样本)
- 样本的选择应涵盖新基质的整个范围(例如:病例和对照组,不同的处理条件)。
- 如果您预期样品间的差异很大(例如,组织培养反应的高可变性、扩展的样品处理条件或样品浓度),则应增加预实验中分析的样品数量,并应包括额外的样品,以确定方法学中的变异性。这将帮助指导后续实验。
- 每个样品应至少用3个稀释梯度进行测试(由实验室根据panel指标特性确定操作)
- 我们的panel开发充分考虑到血浆和血清中的蛋白组成和浓度跨度。应该使用什么稀释度取决于客户感兴趣的靶点蛋白以及浓度,根据验证数据中的分析测量范围进行确认。
- 我们的支持团队可以根据您对基质中蛋白质浓度的预期和所选择的panel,帮助您选择最合适的稀释度。
- 如果您正在分析组织培养样本,并怀疑不同样品之间存在高可变性(即细胞分化), 那么您应该测试重复样本,以确定方法中的可变性。
一旦您对预实验数据满意,则使用最优稀释开展所有样品正式实验。
非标样本—细胞培养上清准备建议
细胞上清准备:
1. 每个细胞培养孔/皿接种相同的初始细胞密度
2. 细胞在细胞培养基中培养稳定后,弃培养基,PBS 洗涤 3 次
3. 转无血清培养基中再培养 24h
4. 收集培养基,1000-2000 x g 离心 10 分钟离心并收集上清
5. 分装≥100ul于Ep管中
6. -80℃保存
注意:
实验样本需包含无细胞的空白培养基
如果任何蛋白质预期是高诱导表达的,实验室会对样品做至少包括两个浓度梯度稀释,以检测任何可能的浓度。
2021年11月12日 11:17
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